Jornal de Ensaios Clínicos
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Abstrato

Bioinformatic Analysis: The Role of LINC00634 in Colorectal Carcinoma

Fang Liu, Fengyihuan Fu*, Yuqiang Nie

Enquadramento: O LINC00634 é altamente expresso no cancro do esófago, e a sua depleção pode suprimir a viabilidade e induzir a apoptose das células cancerígenas do esófago. No entanto, faltam estudos que examinem a relação entre a expressão de LINC00634 e as características clínicas patológicas, os resultados de sobrevivência, os fatores prognósticos e a infiltração de células imunes tumorais de doentes com carcinoma colorretal (CCR).

Objectivo: O nosso objectivo é investigar o papel do LINC00634 no carcinoma colorretal.

Métodos: Obtivemos dados da base de dados pública TCGA (The Cancer Genome Atlas), base de dados GTEx (Genotype-Tissue Expression) e amostras clínicas. O teste de soma de postos de Wilcoxon, o teste de Kruskal-Wallis e a análise de regressão logística foram empregues para avaliar a relação entre a expressão de LINC00634 e as características clinicopatológicas dos doentes com CCR. A curva Receiver Operating Characteristic (ROC) foi construída para avaliar a capacidade do LINC00634 em distinguir entre doentes com CCR e indivíduos normais com base na pontuação da Área Sob a Curva (AUC). Foram realizadas análises univariadas e multivariadas para avaliar a associação entre os fatores prognósticos e os desfechos de sobrevivência. As curvas de Kaplan-Meier e a análise de regressão de Cox foram empregues para determinar a contribuição da expressão de LINC00634 para o prognóstico dos doentes com carcinoma colorretal. A análise de infiltração imunológica e a análise de enriquecimento de conjunto de genes (GSEA) foram realizadas para identificar as funções significativamente envolvidas do LINC00634. Por fim, foi construído um nomograma para verificação interna com base nos dados da regressão de Cox.

Resultados: A expressão de LINC00634 foi regulada positivamente em doentes com CCR e marcadamente associada ao estádio N, tumor residual, estádio patológico e evento de Sobrevivência Global (SG). A curva ROC mostrou que o LINC00634 tinha fortes capacidades diagnósticas e prognósticas (AUC = 0,74). A elevada expressão de LINC00634 pôde prever uma má sobrevivência específica da doença (DSS; P = 0,008) e uma má sobrevivência de overroll (OS; P <0,01). A expressão de LINC00634 foi independentemente associada à OS em doentes com CCR (P = 0,019). A análise de GSEA e de infiltração imunológica demonstrou que a expressão de LINC00634 estava envolvida na transcrição genética, na regulação epigenética e nas funções de certos tipos de células de infiltração imunológica. O índice c do nomograma foi de 0,772 (IC95%: 0,744-0,799).

Conclusão: O nosso estudo revela que o LINC00634 pode servir como um potencial biomarcador prognóstico para doentes com CCR.