A impressão genômica, onde os genes de um dos pais têm propriedades de expressão diferentes das do outro pai, ocorre nas plantas. Tem consequências potencialmente significativas devido à importância dos híbridos na evolução e no melhoramento das plantas e fornece um mecanismo que pode ocultar a variação genética por muitas gerações. O estudo da organização nuclear mostra que a posição do cromossomo e do genoma está relacionada ao imprinting em híbridos F1, com genomas periféricos tendendo a se expressar preferencialmente. Em alguns híbridos poliploides endogâmicos, como o Triticale (um híbrido de trigo x centeio), o tratamento com o agente de desmetilação azacitidina libera variações ocultas, que talvez tenham sido perdidas devido a fenômenos de imprinting.