ISSN: 2329-8936
Rato transcriptoma
O projeto utiliza Sequenciamento Massivamente Paralelo de Assinaturas (MPSS) para traçar o perfil de populações de RNA de um grande número de tecidos de camundongos rigorosamente coletados. MPSS utiliza microesferas para capturar e quantificar tags para mRNAs isolados de tecidos ou células; a identidade dos mRNAs é determinada por sequenciamento de fragmentos de cDNA ligados às esferas. O camundongo C57BL/6J foi escolhido como fonte de tecidos, pois o camundongo oferece consistência de fundo genético, estado pré-mórbido e aquisição de tecido, bem como informações detalhadas do genoma. Estes são elementos essenciais para a criação de um conjunto de dados de expressão gênica significativo.
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