Jornal de Ensaios Clínicos
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Abstrato

Uma nova assinatura de LncRNA relacionada com a cuproptose prevê o prognóstico em doentes com carcinoma do esófago

Shang Peng, Haipeng Li, Jingting Min, Ran An, Nana Du1, Zhenghong Li*

Introdução: O Cancro do Esófago (ESCA) é uma causa significativa de mortalidade relacionada com tumores em todo o mundo. A cuproptose é uma nova morte celular que é diferente de outras que regulam a morte celular, incluindo a ferroptose, a piroptose e a apoptose. No entanto, o papel da cuproptose no início e progressão da ESCA permanece desconhecido.

Materiais e métodos: Os dados do transcriptoma e os dados clínicos de 173 doentes com cancro do esófago na base de dados The Cancer Genome Atlas (TCGA) foram classificados e extraídos com o software Perl. A análise de correlação de Pearson foi realizada nos genes relacionados com a cuproptose e em todos os LncRNAs. Os LncRNAs relacionados com o prognóstico foram determinados por análise de regressão univariada e multivariada de Cox, e foi construído um novo modelo prognóstico para calcular o score de risco de cada doente. A curva C-Index, a análise de componentes principais (PCA) e a análise da curva Receiver Operating Characteristic (ROC) foram utilizadas para avaliar o desempenho de previsão do prognóstico do modelo de LncRNA relacionado com a 3-cuproptose (CRLs). Além disso, foi utilizada a análise multivariada de Cox para avaliar o valor prognóstico do modelo em toda a coorte e nos diferentes subgrupos.

Resultados e discussão: Os critérios de pontuação de risco 3-CRLs, incluindo EWSAT1, AC125437.1 e GK-IT1, foram estabelecidos para avaliar a Sobrevivência Global (SG) da ESCA. A análise de sobrevivência e a curva ROC mostraram que a pontuação teve um bom desempenho de previsão no grupo de treino TCGA e no grupo de teste. Os coeficientes de cada LncRNAs foram analisados ​​utilizando a regressão Lasso e os valores lambda foram determinados. A análise de componentes principais foi utilizada para determinar se as 3-CRL conseguem distinguir claramente o fosso entre as amostras de alto e baixo risco. A regressão multivariada de Cox mostrou que as características dos 3-CRLs eram fatores prognósticos independentes da OS. O mapa de Norman mostrou uma eficácia robusta na previsão do prognóstico.

Conclusão: As características de risco baseadas em 3-CRLs podem ser utilizadas para prever o prognóstico dos doentes com carcinoma do esófago.