Imunoterapia: acesso aberto
Acesso livre
ISSN: 2471-9552
ISSN: 2471-9552
Jinxiang Tan*, Yidan Gao, Zhao Li, Yuanyuan Wang, Linbang Wang
Enquadramento: As MMPs são um grupo de genes da família relacionados com a progressão do cancro, a sobre-regulação da maioria dos genes MMP nos cancros está associada à promoção da invasão, angiogénese e prevenção da vigilância imunológica. No entanto, os padrões de expressão de todas as MMPs ao nível do transcriptoma e ao nível unicelular numa perspectiva pan-cancerígena não foram investigados.
Métodos: Foram aplicados tanto o transcriptoma do Atlas do Genoma do Cancro (TCGA) como os dados pan-cancro de sequenciação unicelular do GEO (Gene Expression Omnibus). O modelo de diagnóstico baseado em MMP foi construído por análise de regressão LASSO. Os tumores foram classificados em grupos de pontuação alta e baixa de MMP pelo ssGSEA. Os dados unicelulares foram analisados pelo pacote Serat. Os caracteres de expressão das MMPs foram validados por qRT-PCR.
Resultados: A MMP1 , MMP11 e MMP12 foram reguladas positivamente em quase todos os tipos de cancro. A MMP19 e a MMP27 são significativamente reguladas negativamente em oito a nove tipos de cancro. A análise de correlação provou uma potencial relação entre a expressão de MMP e a imunidade tumoral e o tumor tumoral. As células imunológicas, incluindo macrófagos, resposta de IFN tipo II e Treg, foram altamente infiltradas no grupo com pontuação baixa de MMP , como esperado, funções incluindo via de sinalização de hipopótamo, regulação positiva da adesão de leucócitos às células endoteliais vasculares, quimiotáxis de células T mais ativos na pontuação da MMP- grupo alto. A análise unicelular revelou diversos padrões de expressão de MMP em diferentes agrupamentos de células. Em que, a MMP7 é altamente expressa nos macrófagos e a MMP2 é altamente expressa nas células T CD8 + .
Conclusão: A maioria das MMPs aumentou a expressão em todos os tipos de cancro, as MMPs mostraram potencial valor diagnóstico em combinação.