Jornal de antivirais e antirretrovirais
Acesso livre
ISSN: 1948-5964
ISSN: 1948-5964
Asit K. Chakraborty
Previmos anteriormente a proteína do vírus Nsp2 Corona como RNA topoisomerase através da homologia de aminoácidos entre Vibrio haemolytica DNA topoisomerase IA / IV, bem como DNA primase, DNA girase e bi-subunidade Trypanosoma brucei DNA topoisomerase IB. Muitas topoisomerases I/III de ADN têm atividade de topoisomerase de ARN e estas enzimas ubíquas são conservadas e envolvidas na regulação da replicação e transcrição. Verificamos aqui o perfil mutacional da topoisomerase do RNA Nsp2 analisando> 10.000 orf 1a 4.405 aminoácidos de comprimento da poliproteína do vírus Corona. As proteínas mutantes foram selecionadas por pesquisa BLAST com 99,84% de similaridade de sequência e a proteína NsP2 com uma porção de 181-818 aa (proteína id. QIU82057) foi analisada com o software CLUSTAL Omega. Encontrámos 26 mutações diferentes onde a maioria das alterações foram selecionadas em isoleucina e alanina em valina ou leucina em fenilanalina, identificando a natureza conservada da topoisomerase de RNA do vírus Corona. Foram encontradas mutações nonsense importantes e muito abundantes em I120F (Isoleucina para Fenilalanina). Outras mutações importantes foram R27C, I198V, T85I, L410F, I559V e P583S. A mutação I120F foi abundante nos isolados australianos e a sua disseminação foi observada no Bangladesh e noutros países como os EUA. Sugerimos que a abundante mutação I120F da topoisomerase Nsp2 pode aumentar a transmissão do vírus Corona, estabilizando a estrutura do RNA para um empacotamento eficiente do vírus. Curiosamente, tais mutações foram encontradas em associação com a mutação D614G da proteína Spike, conhecida por aumentar a infectividade em> 70%. Pelo contrário, todos os mutantes P583S Nsp2 analisados não apresentaram concordância com a mutação da proteína spike D614G. Muitas mutações silenciosas (5-7) foram detetadas por análise genómica ampla, mas nenhuma mutação da proteína N501Y Spike. Este é o primeiro relatório que prevê uma ligação entre uma maior transmissão do vírus Corona com a mutação da proteína Nsp2 I120F e pode ser importante para a descoberta de novos fármacos antivirais.