Imunoterapia: acesso aberto
Acesso livre
ISSN: 2471-9552
ISSN: 2471-9552
Deyu Chen, Peng Han et Feng Yang*
Objectif : Cette étude a donc été conçue pour mener une analyse robuste du microenvironnement immunitaire du cancer colorectal (CCR) afin d’identifier des gènes et des voies spécifiques qui peuvent être ciblés dans le but d’obtenir des résultats d’immunothérapie plus efficaces.
Méthodes : À l'aide de cinq ensembles de données indépendants, nous avons analysé les profils d'expression associés à 29 signatures immunitaires différentes et nous avons utilisé ces profils pour guider le regroupement hiérarchique des échantillons de CCR en fonction de leur composition microenvironnementale immunitaire.
Résultats : Nous avons pu regrouper nos échantillons de CCR en fonction de leur niveau élevé, moyen ou faible d'infiltration par des types de cellules immunitaires associés à la clairance tumorale (respectivement Immunité-H, Immunité-M et Immunité-L). Les échantillons du sous-ensemble Immunité-H présentaient un microenvironnement immunitaire « chaud », avec des scores stromaux et immunitaires plus élevés et une pureté tumorale plus faible. Le groupe d'instabilité microsatellite (MSI) comprenait la majorité des échantillons Immunité-H, tandis que la plupart des échantillons Immunité-M et Immunité-L étaient intégrés dans le groupe de stabilité microsatellite (MSS). La grande majorité des patients porteurs de mutations KRAS se trouvaient dans les groupes Immunité-L et MSS, tandis que la majorité des patients présentant des mutations BRAF V600E se trouvaient dans les échantillons Immunité-H et MSI-H. Les échantillons TMB élevés comprenaient une majorité d'échantillons Immunité-H et un petit sous-ensemble d'échantillons Immunité-M. LCK, GNGT2, CD3G, CCR4 et CCR5 étaient significativement enrichis dans des voies telles que l'activation des cellules T, la différenciation des lymphocytes et l'adhésion cellule-cellule des leucocytes lors de la comparaison des échantillons Immunité-H et Immunité-L.