ISSN: 2471-9315
Fatah Tazerart, Jamal Saad, Muriel Militello, Sophie Alexandra Baron, Michel Drancourt*, Sylvain Godreuil*
Uma amostra de lavado broncoalveolar foi coletada por broncoscopia de um paciente cambojano de 25 anos com suspeita de tuberculose clínica e foi inoculada em meio Löwenstein-Jensen. Colônias de uma bactéria Gram-positiva e álcool-ácido resistente, não cromogênica e de rápido crescimento foram investigadas. A microscopia eletrônica de varredura mostrou bacilos de 1,2 ± 0,29 μm de comprimento e 0,58 ± 0,07 μm de largura que não puderam ser identificados usando espectrometria de massa de ionização por dessorção a laser assistida por matriz de rotina-tempo de voo-testes fenotípicos (ensaios API ® ZYM, API ® Coryne e Biolog ® Phenotype MicroArray). In vitro, o isolado foi suscetível a isoniazida, amicacina e trimetoprima-sulfametoxazol. O sequenciamento do genoma completo produziu um genoma de rascunho de 5.703.981 pb que exibiu 69,3% de conteúdo GC com 5.207 genes de proteína codificadora e 56 genes de RNA previstos, incluindo 3 rRNAs. A sequência rpoB mostrou 93% de similaridade de sequência com a de Mycobacterium parascrofulaceum no complexo Mycobacterium simiae. A hibridização de DNA-DNA derivada da sequência do genoma, OrthoANI e análises pan-genômicas confirmaram que este isolado representava uma espécie não descrita dentro do complexo M. simiae. Esta espécie foi denominada Mycobacterium cambodiensis após sua fonte de isolamento. O isolado foi depositado na Collection de Souches de l'Unité des Rickettsies (CSUR) com o número CSURP9652.