Jornal de antivirais e antirretrovirais
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Abstrato

Detecção de um novo coronavírus (SARS-CoV-2) por reação em cadeia da polimerase com transcrição reversa em tempo real, China, 2020

Huahua Feng, Honglong Wu, Huagui Wang, Jianying Yuan, Lu Chen, Hui Jin, Lingling Yang, Jinyin Zhao*, Licheng Liu*, Weijun Chen*

Enquadramento: Durante o surto de pneumonia inexplicável na cidade de Wuhan, no final de dezembro de 2019, foi identificado um novo coronavírus denominado SARS-CoV-2 como a causa deste surto.

Métodos: Uma reação em cadeia da polimerase em tempo real, que tem como alvo o gene orf1ab do genoma viral, foi estabelecida para detetar e identificar o SARS-CoV-2. Utilizámos este ensaio para rastrear 309 amostras de pessoas com suspeita de infeção por SARS-CoV-2 em Wuhan. De seguida, foram detetados 6 coronavírus filogénicos próximos e 7 vírus que poderiam causar pneumonia. Além disso, foram também testadas 57 amostras clínicas infetadas com outros vírus e 77 amostras saudáveis.

Resultados: O limite de deteção do ensaio foi de 6,25 cópias por reação na deteção de cRNA transcrito in vitro . Os resultados da deteção de esfregaços fecais e da garganta de pessoas com suspeita de infeção por SARS-CoV-2 mostraram que os esfregaços da garganta foram mais sensíveis do que os esfregaços fecais durante os primeiros 15 dias após o início dos sintomas (garganta: 56 ,80%, fecais: 30,43%), enquanto a situação se inverteu ao fim de 15 dias (garganta: 20,83%, fecal: 27,58%). E os testes de pares combinados sugeriram que as amostras de expetoração tinham cargas virais mais elevadas do que os esfregaços de garganta nos doentes (P<0,05). Não se verificou reação cruzada quando detetámos a cultura inativa de outros seis coronavírus (coronavírus humano 229E, NL63, OC43, HKU1, SARS-CoV, MERS-CoV) e outros sete vírus (vírus influenza A H1N1, vírus influenza A H3N2, vírus influenza B , vírus parainfluenza 1, 2 e 3; Além disso, 27 amostras de LBA de doentes com pneumonia infetados com coronavírus humano 229E, OC43, HKU1 ou adenovírus humano 7, 30 esfregaços de garganta de doentes infetados com H1N1 e 77 esfregaços de garganta de pessoas saudáveis ​​tiveram um resultado negativo neste ensaio.

Conclusão: Os resultados indicaram que o ensaio detetou de forma específica e sensível o SARS-CoV-2.