Medicina de Emergência: Acesso Aberto
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Abstrato

A heme oxigenase é um controlo molecular que melhora as dificuldades cardiorrenais na diabetes

José F. Ndisang

ABSTRATO

Até à data,  a Dioscorea (inhame) no Quénia é uma cultura negligenciada, apesar do seu potencial como alimento e na indústria farmacêutica como fonte de medicamentos. A investigação sobre culturas negligenciadas, especificamente Dioscorea, é uma forma segura de sensibilizar a comunidade científica e os decisores políticos sobre o assunto. Tem sido referido que vários vírus de diferentes géneros infectam o inhame ( Dioscorea spp .). A diversidade completa de vírus que infectam o inhame, no entanto, ainda tem de ser explorada.

A sequenciação de alto rendimento (HTS) e a utilização de métodos de marcadores POX estão a ser progressivamente utilizadas na descoberta de novos genomas virais de plantas e processos de metabolismo em plantas.

Neste estudo, irei empregar o HTS no inhame para determinar se estará presente algum vírus não descoberto que restringiria a distribuição internacional do germoplasma do inhame. A descoberta funcionará na descoberta de uma nova sequência de vírus presente. Trinta e uma (31) amostras de inhame serão testadas e provisoriamente denominadas como vírus “vírus do inhame Y” (YVY). A reação metabólica que pode trazer mutação será testada pelo uso do marcador Peroxidase à medida que atingem o processo de Arabiodisis no metabolismo do organismo. Serão montadas sequências completas do genoma de dois isolados virais YVY e serão feitas outras descobertas para enviar texto de cinco open reading frames (ORFs). A ORF1 codifica uma grande proteína associada à replicação, a ORF2, a ORF3 e a ORF4 constituem as supostas proteínas de bloqueio genético triplo, e a ORF5 codifica uma suposta proteína de revestimento, uma vez que o inhame contém dioscorina que está repleta de proteína. Considerando os critérios de demarcação de espécies da família Betaflexiviridae, o YVY deve ser considerado uma nova espécie de vírus na família Betaflexiviridae. Serão necessários mais trabalhos de investigação para compreender a associação deste novo vírus com eventuais sintomas e perda de rendimento e a sua implicação na produção de sementes de inhame livres de vírus.

Palavras-chave: RNA-Seq; deteção de vírus; Betaflexiviridae; sequenciação de próxima geração; HTS

Este trabalho será apresentado no 6º Congresso Mundial de Plantas Medicinais e Drogas Marinhas (Plantas Medicinais 2020 - Webinar) de 24 a 25 de Junho de 2020

Introdução

O inhame, ( Dioscerea spp), que é uma das culturas de subsistência mais importantes cultivadas na África Oriental, é uma cultura anual de tubérculos tropicais que possui tubérculos com um conteúdo energético de 25 a 30%. O inhame é, portanto, uma das culturas de subsistência mais importantes cultivadas na África Oriental e que tem sido negligenciada.

As doenças virais, que podem ocorrer frequentemente como infeções múltiplas, são uma grande restrição à produção de inhame e podem causar atrofiamento das plantas, redução da folhagem, diminuição do conteúdo energético dos tubérculos e, em plantas individuais, perdas de rendimento de até 93 %. Embora membros de 140 espécies de vírus possam infectar natural ou artificialmente inhames, apenas doze destas espécies foram encontradas até agora em África, das quais apenas três foram relatadas em E. African. Os vírus em oito destas doze espécies são transmitidos por sementes, factor que dificulta seriamente o seu controlo eficaz. Por exemplo, a transmissão de sementes pode atingir 2% para o YV, 6,9% para o vírus – uma estirpe do vírus do mosaico do inhame (YMV) e 13,3% para o vírus do mosaico do pepino (cMV; Dado que uma diversidade muito mais ampla de vírus que infectam o inhame tem foram descobertos noutras partes de África, é provável que ainda não sejam descobertos vírus que infectam o inhame no Quénia. O conhecimento limitado disponível sobre os vírus que infectam o inhame neste país dificulta o controlo de doenças, particularmente no que diz respeito à produção de sementes isentas de doenças e à criação de variedades de inhame resistentes a vírus. através da utilização de marcadores HTS e POX.

Enunciado do problema

A questão das espécies Dioscorea cultivadas no Quénia constituiu a base deste estudo. Este estudo teve como objetivo resolver isto através da filogenia molecular utilizando sequências de nucleótidos de DNA e RNA relacionando-as com espécies africanas conhecidas e espécies com informação no banco genético. O estudo também tem como alvo o novo vírus no inhame que dificulta a reação metabólica do inhame, diminuindo consequentemente o nível de Dioscorin que contém uma grande quantidade de proteínas que acrescentam o valor nutricional do inhame.

Justificação

A Dioscorea é uma cultura importante tanto para a alimentação como pelo seu potencial medicinal. A taxonomia de Dioscorea , tanto no Quénia como a nível mundial, tem sido um grande desafio para os taxonomistas com base na caracterização morfológica. Várias razões têm sido associadas à dificuldade na taxonomia das espécies Dioscorea . Em primeiro lugar, a taxonomia de Dioscorea é um desafio devido à complexidade e plasticidade do carácter taxonómico dentro de uma espécie, daí a dificuldade na sua identificação e devido às alterações ambientais que o vírus trouxe mutação em vírus e inhames. Em segundo lugar, a Dioscorea tem sido uma cultura negligenciada pelos investigadores de todo o mundo. A diferenciação clara das espécies é de extrema importância para fins de reprodução. O mapeamento de espécies de um determinado organismo é essencial não só para fins de conservação, mas também para fins de reprodução. A filogenia molecular pode ser utilizada para posicionar espécies de vírus em taxa morfologicamente complexos em Dioscorea pelo uso de sequenciação de alto rendimento e marcadores Pox, o vírus é propenso e afeta a composição genética do inhame, diminuindo assim a produtividade do inhame.