Imunoterapia: acesso aberto
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Abstrato

Transcrições imunes da ostra do Pacífico: larvas de Crassostrea gigas que mudam de expressão como resultado do desafio bacteriano

Jing Fang, Xiaohui Cai, Fengyi Mao, Hongyu Li, Honglin Chen, Minhua Qian, Jacob R. Hambrook, Patrick C. Hanington, Xinzhong Wu

Enquadramento: Os moluscos marinhos que vivem em zonas intertidais e estuarinas, como as ostras, enfrentam numerosos desafios patogénicos durante o seu desenvolvimento. A infecção por bactérias como Vibrio alginolyticus representa um factor importante que afecta o desenvolvimento larvar e conduz frequentemente a uma elevada mortalidade da ostra do Pacífico, Crassostrea gigas . A resposta imunitária da ostra é conhecida por desempenhar um papel importante na proteção do animal durante o desenvolvimento, atenuando as consequências da infeção.

Resultados: Neste estudo, realizámos uma análise abrangente da resposta imunitária das larvas de C. gigas ao desafio de V. alginolyticus . Sequenciamos o transcriptoma da larva C. gigas às 0 horas, o que significa a ostra larvar sem qualquer tratamento como controlo e 6, 12, 24, 48 e 72 horas pós-infecção. Após o RNA-seq, as leituras em bruto estão disponíveis através do NCBI Sequence Read Archive sob o número de acesso PRJNA623063. Após a filtragem, um total de leituras limpas de 58,24 Gb foram produzidas e montadas utilizando o genoma de referência de C. gigas . A distribuição da qualidade Q30 foi superior a 90,88% para cada amostra e o teor de GC variou entre 41,27% a 42,91%. Quando comparado com as sequências nas bases de dados COG, GO, KEGG, Swiss-Prot e NR, houve 1.267, 1.112, 2.187, 682, 1.133 genes expressos diferencialmente anotados às 6, 12, 24, 48, 72 horas pós-infecção, respectivamente . Numerosos genes relacionados com o sistema imunitário exibiram uma expressão diferencial que variou ao longo do tempo: recetores toll-like, proteínas de motivo tripartido, fatores semelhantes a lectinas, recetores scavenger, componentes da via de sinalização, como o fator de diferenciação mielóide 88, e proteínas de stress, como a proteína de choque térmico de 70 kDa foram todos encontrados em maior abundância após o desafio com V. alginolyticus em comparação com o controlo. Para análise, estes genes foram divididos em várias categorias, tais como recetores de reconhecimento de padrões, proteínas semelhantes ao fibrinogénio, padrões moleculares associados a danos, fatores do complemento , etc. . gigas .​​​​​ , ligação ao heme proteína 1, proteína de ligação ao heme 2, proteína de ligação a metais pesados ​​HIP, hemicentina-1, etc. de infecção. Estes resultados indicam que a infecção bacteriana induz um padrão complexo de expressão génica imunitária em larvas de C. gigas .

Conclusão: O nosso estudo facilitará a investigação direcionada sobre a função de fatores imunológicos específicos que podem explicar a diversidade e evolução das moléculas imunes de invertebrados e levar ao desenvolvimento de medidas eficazes para melhorar o desempenho da cultura de ostras.