Jornal de Imunologia Clínica e Celular
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Abstrato

Vacina Imunoinformática-Peptídica e Modelagem In Silico para Glicoproteína G do Vírus da Raiva de Duvenhage

Sahar Obi Abd Albagi, Omar Hashim Ahmed, Manal Abdalla Gumaa, Khoubieb Ali Abd_elrahman, Ahmed Hamdi Abu-Haraz e Mohammed A. Hassan

Histórico: O vírus da raiva Duvenahge pertence à família do gênero Lyssavirus Rhabdoviridae, causando infecção fatal sem tratamento eficaz disponível e nenhuma vacina de DNA ou peptídeo licenciada até o momento. O objetivo do presente estudo foi prever a vacina peptídica para o vírus da raiva Duvenhage.
Métodos e materiais: As sequências do vírus Duvenahge foram selecionadas do NCBI e, em seguida, submetidas a muitos testes de células B e T do IEDB para obter os peptídeos mais promissores que poderiam atuar como vacina peptídica dirigida. A análise de cobertura populacional foi realizada para peptídeos selecionados usando o IEDB e, finalmente, a modelagem de homologia e os estudos de encaixe molecular foram feitos para visualizar a interação com moléculas MHC1.
Resultado e conclusão: Entre os peptídeos testados para o teste de células T, este estudo projetou um epítopo interessante de célula T (YFLIGVSAV) que exibe afinidade de ligação totalmente consumidora como forte indicador para os alelos MHC-Um e MHC-dois juntos, além da ligação a dezoito alelos por meio da cobertura populacional de 99,36% no mundo. Esses resultados foram ainda mais apoiados por estudos de docking molecular que mostram excelente interação com a molécula de homo spins do MHC com a menor energia de ligação entre os peptídeos testados.
Apenas três epítopos de células B (AHYK, YTIPDKL e SLNHPYPDSH) foram encontrados para sobrepor todos os testes de células B realizados por serem lineares, na superfície da glicoproteína G e serem antigênicos.