Imunoterapia: acesso aberto
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Abstrato

Analyse intégrative des profils d'expression génétique pour identifier les biomarqueurs liés à l'infiltration immunitaire : dans la lésion de l'endométriose

Xiang Kong*, Taung Xio

Des études récentes ont montré le rôle crucial du système immunitaire dans la pathogenèse et la progression de l'endométriose (EM). Cette étude vise à identifier la signature de l'infiltration des cellules immunitaires et les biomarqueurs diagnostiques liés à l'immunité de l'EM grâce à une analyse multi-bioinformatique. Grâce à l'algorithme xCell calculant l'ensemble de données commun de l'EM, nous avons découvert que les macrophages et les neutrophiles constituent les cellules immunitaires les plus infiltrantes dans le tissu de l'endomètre. Nous avons identifié 816 gènes différentiellement exprimés (DEG) entre les lésions d'EM et l'endomètre normal. Nous avons également construit l'analyse du réseau de coexpression génique pondéré (WGCNA) pour identifier le module hub lié à l'immunité. Le diagramme de Venn du module hub, des DEG et des gènes liés à l'immunité a identifié quatre gènes hub liés à l'immunité de l'EM (TNFSF13B, IL7R, CSF1R et LEP), qui étaient tous significativement régulés à la hausse dans les lésions d'EM par rapport à celles des témoins. De plus, nous avons utilisé plusieurs ensembles de données indépendants pour valider nos résultats. L'aire sous les courbes ROC (AUC) de ces gènes pivots pour le diagnostic de la maladie était supérieure à 0,8. Nous avons également constaté que ces gènes pivots étaient liés de manière conjonctivale à la complication courante de l'infertilité due à l'EM.