ISSN: 2155-9899
Karin ME Andersson1, Eric Malmhäll-Bah1, Nina Y.Oparina1, Weiyang Tao1, Aridaman Pandit2, Malin C. Erlandsson1,3, Venkataragavan Chandrasekaran1, Sofia T. Silfverswärd1, Rille Pullerits1,3,4, Maria I. Bokarewa1,3*
Objetivo: Estudamos os mecanismos moleculares por trás da reconstituição das células T na artrite reumatoide (AR) perguntando se o PBX1, um fator de transcrição que mantém a pluripotência das células-tronco, prevê a resposta ao tratamento antirreumático.
Métodos: A transcriptômica do genoma completo por sequenciamento de RNA foi feita em células T CD4 + de 87 pacientes com AR com baixa atividade da doença e de 78 pacientes com AR com alta atividade da doença. Os resultados do tratamento nos grupos PBX1 hi e PBX1 lo foram comparados. O fenótipo associado ao PBX1 e os processos biológicos foram identificados pelo agrupamento dos genes diferencialmente expressos em células CD4 + PBX1 hi . Os agrupamentos de PBX1 hi no timo foram identificados por uma análise baseada em célula única. Os alvos transcricionais de PBX1 entre DEGs foram previstos pela análise integrativa do motivo de DNA, sequenciamento de imunoprecipitação da cromatina e dados de cromatina aberta.
Resultados: As células PBX1 hi CD4 + tinham características impressas de pluripotência e não tinham produção de citocina. Na AR ativa, as células PBX1 hi foram enriquecidas com progenitores de linfócitos pré-tímicos CD34 + . Os pacientes PBX1 hi tiveram melhor redução de DAS28 no tratamento anti-TNF e baixa frequência de não respondedores em comparação com PBX1 lo (ambos, p = 0,026). Na AR inativa, as células PBX1 hi foram enriquecidas com células T pós-tímicas virgens expressando CD62L/SELL e CD31/PECAM1. Aqui, os pacientes PBX1 hi precisaram de menos tratamento para atingir a remissão em comparação com os pacientes PBX1 lo (p = 0,011). No timo, CD34 e PECAM1 foram anotados dentro dos clusters PBX1 hi . A análise integrativa revelou que os genes de maturação de células T centrais TBX21, PRDM1, BATF3 e KLF1 eram transcricionalmente dependentes de PBX1.
Conclusão: Este estudo mostra que o enriquecimento para PBX1 está associado ao fenótipo pluripotente de células CD4 + , o que favorece as respostas ao tratamento na AR.