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Abstrato

A procura por um arroz mais tolerante: como é que as elevadas concentrações de ferro afetam o splicing alternativo?

Artur Teixeira de Araujo Junior, Daniel da Rosa Farias, Railson Schreinert dos Santos, Marcelo Nogueira do Amaral, Luis Willian Pacheco Arge, Danyela de Cássia Oliveira, Solange Ferreira da Silveira Silveira, Rogério Oliveira de Sousa, Eugenia Jacira Bolacel Braga, Luciano Carlos da Maia e António Costa de Oliveira

O arroz (Oryza sativa L.) é um alimento básico global e um importante organismo modelo para estudos de plantas. Relatórios recentes mostraram que o splicing alternativo é afetado por muitas condições de stress, sugerindo a sua importância para a adaptação a ambientes adversos. Devido à pouca informação sobre este assunto, este estudo teve como objetivo explorar as alterações nos padrões de splicing que ocorrem em resposta à elevada concentração de ferro em soluções nutritivas. Aqui quantificamos diferentes tipos de junções e eventos de splicing no transcriptoma de uma cultivar de arroz relativamente tolerante, BRS Querência, sob excesso de ferro com uma concentração de 300 mg L-1 Fe+2. As plantas mantidas em condições padrão (controlo) apresentaram 127.781 junções de emendas diferentes, enquanto as plantas stressadas apresentaram 123.682 junções diferentes. Foram encontradas junções canónicas (98,85% e 98,91%), semicanónicas (0,73% e 0,70%) e não canónicas (0,42% e 0,40%) nas plantas controlo e stressadas, respetivamente. A retenção de intrões foi o evento mais frequente (44,1% e 47,4%), seguida pelo local de splicing 3’ (22,6% e 21,9%), salto de exons (18,9% e 17 ,3%) e local de splicing 5’ alternativo (14,4% e 13,4%). ) nas plantas controlo e stressadas, respectivamente. Encontrámos também 25 genes expressos diferencialmente (cinco regulados para cima e 20 para baixo) que estão relacionados com modificações pós-traducionais. Estes resultados representam um passo importante na compreensão de como ocorrem as respostas ao stress das plantas num genótipo tolerante ao ferro, descobrindo novos genes envolvidos na resposta ao stress do ferro.