Jornal da Leucemia
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Abstrato

Utilização de sequenciamento profundo de última geração para analisar mutação do domínio da cinase BCR-ABL1 para pacientes com leucemia mieloide crônica resistente a imatinib no Vietnã

Duong CQ, Nguyen C, Nguyen TT, Nguyen LV, Pham HQ, Trinh HTT, Tran HC, Le TQ, Pham HT, Hong TH, Nguyen TH, Truong HN, Bach KQ e Nguyen TA

Histórico: A leucemia mieloide crônica é uma neoplasia mieloproliferativa clonal, caracterizada pela presença de translocação cromossômica t(9; 22)(q34; q11). Isso é encontrado em mais de 95% dos casos e resulta na proteína de fusão BCR-ABL1 com alta atividade de tirosina quinase. Durante as últimas décadas, o imatinib e outras gerações de inibidores de tirosina quinase têm sido usados ​​efetivamente para terapia alvo da doença. No entanto, muitos dos casos de resistência a medicamentos foram relatados recentemente, devido à mutação no domínio quinase do gene de fusão BCR-ABL1. Para fornecer mais informações sobre essa incidência, realizamos um estudo retrospectivo de 141 pacientes com leucemia mieloide crônica resistente ao imatinib para analisar a mutação do domínio quinase por sequenciamento profundo. Outro grupo de 20 pacientes não tratados foi adicionado como controle. Métodos: O RNA de células da medula óssea foi extraído e seguido pela síntese de cDNA. A reação em cadeia da polimerase aninhada foi realizada para amplificar o domínio quinase do gene de fusão BCR-ABL1. Os produtos amplificados foram monitorados quanto ao tamanho, concentração e biblioteca de sequenciamento de DNA preparada. A análise de sequência foi realizada usando o sequenciador Illumina MiSeq e o software Sequence Pilot. Os resultados do sequenciamento foram escolhidos aleatoriamente para sequenciamento Sanger. Resultados: Nenhum do grupo controle foi positivo com mutação do domínio quinase. Houve 47 de 141 pacientes (33%) detectados com pelo menos uma substituição de nucleotídeo. Os resultados do sequenciamento também foram confirmados pelo sequenciamento Sanger. Dessas 47 amostras, 72 substituições de nucleotídeos de 28 tipos, 24 códons alterados foram identificados. Entre eles, Y253F/H, M351T, G250E, F359V/I e M244V foram as mutações mais frequentes, enquanto T315I levou apenas 4,1%. Houve também uma série de amostras abrigando múltiplas substituições e novas variações. Conclusão: O sequenciamento profundo de última geração é um método sensível e eficaz para detectar mutações no domínio da quinase e nossos resultados podem fornecer mais informações sobre a mutação de resistência a medicamentos na leucemia mieloide crônica.