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Abstrato

Expressão diferencial de genes de truta ameaçada da neve dos Himalaias desafiada com Aeromonashydrophilla

Ashoktaru

A truta da neve (Schizothorax richardsonii) é endémica da região de altitude dos Himalaias e prospera bem num regime térmico amplo (0-27°C). A espécie pode ser utilizada como espécie modelo para estudar a resposta ao stress abiótico e biótico de espécies de peixes de água fria. No presente estudo, comparámos os transcriptomas hepáticos de S. richardsonii desafiados por Aeromonas hydrophilla (Ah+) e simulados (Ar-). A base de dados do transcriptoma para a espécie foi desenvolvida com uma cascata de genes diferencialmente expressos relacionados com o sistema imunitário utilizando sequenciação de RNA (2 × 100 pb emparelhados) realizada na plataforma de sequenciação Illumina 2000. Entre 50.453 unigenes obtidos a partir da montagem de novo, foram anotados 24.464 unigenes, entre os quais 82 unigenes estavam associados a genes de respostas imunitárias. Havia 265 unigenes expressos diferencialmente (189 regulados positivamente e 75 regulados negativamente) no Ah + em comparação com o grupo Ah. A maioria dos genes envolvidos na regulação imunológica durante a patogénese bacteriana estão ligados à região extracelular, integridade da membrana, ligação de iões, transdução de sinal, processamento e apresentação de antigénios, complexo proteico de classe I do MHC, etc. associados à resposta imunitária e 9 unigenes relacionados com os termos da ontologia genética de transdução de sinal foram significativamente desregulados no grupo desafiado por bactérias. Verificou-se que quatro genes imunitários interleucina 1β1, prostaglandina-endoperóxido sintase 2a e 2b e domínio de repetição de anquirina são muito ativos contra A. hydrophilla. O presente estudo fornece uma visão preliminar sobre possíveis alterações ao nível molecular deste potencial peixe modelo durante uma infestação patogénica.