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Abstrato

Identificação da afinidade de ligação dos péptidos TAP para o desenvolvimento da vacina baseada em fragmentos da neurotoxina longa 2 [ N. naja ]

Sherkhane AS e Gomase VS

A proteína neurotoxina 2 longa do veneno de Naja naja apresenta grande afinidade com os receptores de acetilcolina, o que produz paralisia periférica ao bloquear a transmissão neuromuscular no sítio pós-sináptico. Neste estudo, utilizámos um método TAPPred baseado em SVM em cascata que encontrou 26 regiões peptídicas do transportador TAP de alta afinidade. A TAP é uma proteína transmembranar heterodimérica que transporta proteínas peptídicas antigénicas para o retículo endoplasmático, onde se liga às moléculas do MHC de classe I. Estes complexos MHC-peptídeo serão translocados na superfície das células apresentadoras de antigénio (APCs), onde são reconhecidos pelas células T. receptores para provocar uma resposta imunitária. Portanto, a previsão de peptídeos de ligação ao TAP é útil na identificação dos epítopos de células T restritos à classe I do MHC e, portanto, útil na conceção de vacina peptídica sintética.