Journal of Food: Microbiologia, Segurança e Higiene
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Abstrato

Diversidade da microflora sobrevivente aos tratamentos de descontaminação de carcaças de carne pasteurizada avaliada através de métodos de impressão digital PCR-DGGE baseados no cultivo e aninhados Estudo poblacional

Bassirou Ndoye, Xianqin Yang, Le Luo Guan, Khalifa Ababacar Sylla, Mamoudou H. Dicko, Ibrahima Ndoye, Alfred S. Traore, Amadou Tidiane Guiro, Colin O. Gill

A diversidade da microflora foi determinada para avaliar a eficácia dos tratamentos de descontaminação em carcaças de carne pasteurizada num grande matadouro no Canadá. Os principais objetivos foram caracterizar a diversidade bacteriana sobrevivente nas amostras tratadas termicamente e tratadas com DNase-I em relação às amostras não tratadas de carcaças de carne pasteurizada. Os métodos baseados no cultivo foram combinados com métodos de impressão digital nested PCR-DGGE para quantificar baixos números de sobrevivência bacteriana em cada amostra. Utilizando o marcador de referência DGGE, foram detectados sete géneros ( Pseudomonas, Staphylococcus, Propionibacterium, Chryseobacterium, Flavobacterium, Ralstonia, Paenibacillus ) tanto pelo DGGE como pelo método baseado no cultivo. Três espécies ( Streptococcus salivarius, Micrococcus luteus e Leuconostoc mesenteroides ) foram encontradas exclusivamente em culturas puras com um método baseado no cultivo. Foram encontrados mais de quinze géneros por PCR-DGGE utilizando tanto as estirpes do marcador DGGE como as bandas em amostras reais, indicando a maior diversidade determinada por esta técnica. Por outro lado, a maior quantidade de espécies foi detectada pelo método baseado no cultivo (29 e 88 em 34 amostras tratadas termicamente e não tratadas, respectivamente). Foram detetados cinco isolados de E. coli da família Enterobacteriaceae em amostras não tratadas com métodos de plaqueamento, demonstrando a utilidade do processamento de amostras de carne com descontaminação e tratamentos térmicos. No entanto, a maioria das espécies ou géneros não identificáveis ​​por cultura foram quase detetados por PCR-DGGE, confirmando a eficácia da combinação de métodos independentes e dependentes da cultura para traçar o perfil completo de bactérias em amostras de alimentos.