Journal of Food: Microbiologia, Segurança e Higiene
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Abstrato

Marcadores genéticos específicos do hospedeiro de bactérias fecais para rastreio de origem fecal em alimentos e água

Guolu Zheng e Zhenyu Shen

A poluição fecal nos alimentos e na água é a principal causa de surtos de doenças, pelo que a identificação precisa desta poluição fecal nestes locais é fundamental para prevenir tais surtos. O rastreio de fontes fecais (FST) é uma ferramenta eficaz para identificar as fontes (humanas versus animais) de qualquer instância específica de poluição fecal. Muitas tecnologias FST foram desenvolvidas nas últimas duas décadas e utilizadas principalmente para monitorizar e gerir a qualidade da água, mas as suas aplicações têm recentemente atraído mais atenção nos sistemas alimentares. Com os grandes avanços das tecnologias em sequenciação de ADN e ferramentas de bioinformática relacionadas, um número significativo de novos marcadores genéticos de bactérias indicadoras fecais (FIB) foram identificados como associados a espécies hospedeiras específicas e, portanto, adequados para FST. Os marcadores genéticos específicos do hospedeiro estavam originalmente limitados às sequências de rDNA 16S do FIB, que são relativamente conservadas. Os novos marcadores genéticos incluem genes da interação bactéria-hospedeiro e sequências intervenientes no rDNA 16S e 23S das bactérias fecais. No entanto, a maioria dos marcadores genéticos só foram avaliados em laboratório e os seus valores competitivos na monitorização e gestão da segurança alimentar e da água necessitam de avaliações adicionais no terreno.