Chen-Yi Chang1, Su-xian Zeng2, Yuan-Ding Ma1, Jun-Wen Zheng1, Xin Li1, Chen-Yong Xiong1, Hong-Jin Zhou1, Chun-Tao Wei1, Zong-Qiang Li
Para identificar os genes importantes que afetam as diferenças fenotípicas entre os porcos Landrace e Debao, especialmente as diferenças no metabolismo e no crescimento muscular. Genes diferencialmente expressos do psoas maior foram detectados pelo sequenciamento do transcriptoma do mRNA em porcos Landrace e Debao. Ao extrair o RNA total do músculo psoas maior do porco Landrace e do porco Debao, purificar o mRNA, construir a biblioteca de cDNA, conduzir o sequenciamento do transcriptoma e, em seguida, por meio da avaliação da qualidade do sequenciamento, sabemos que a qualidade do sequenciamento deste estudo é relativamente alta. Um total de 17.943 genes foram detectados em todas as amostras, incluindo 17.870 genes conhecidos e 73 novos genes. Genes definidos com |log2FC| maior que 2 e valor Q menor que 0,001 e rastreados como genes significativamente diferencialmente expressos. Um total de 1661 genes diferencialmente expressos foram rastreados a partir de amostras de porcos Landrace e porcos Debao, entre os quais 1255 genes foram diferencialmente regulados positivamente e 406 genes foram diferencialmente regulados negativamente. Por meio da análise diferencial de genes, conclui-se que esses genes estão envolvidos principalmente na regulação metabólica, desenvolvimento muscular e de gordura e outros processos, especialmente alguns genes funcionais importantes, como MAPK14, FOS, SIRT1, KRAS, EGR1, CDNNB1, etc. Para resumir, este estudo usou o método de sequenciamento do transcriptoma e, em seguida, selecionou genes diferencialmente expressos entre porcos Landrace e porcos Debao por meio da análise de dados e, finalmente, rastreou genes importantes que afetam as diferenças fenotípicas, o que forneceu suporte genético para a criação de raças melhores no futuro.