Engenharia Enzimática
Acesso livre

Abstrato

Propensão de purificação de proteínas de Bacillus halodurans

Shaomin Yan e Guang Wu

A demanda por proteínas com propósitos especiais aumenta significativamente. Essas proteínas são geralmente obtidas por meio de proteínas recombinantes, no entanto, sua purificação é cara e não é fácil. É necessariamente importante desenvolver um método para estimar a chance de purificação de antemão para ter uma perspectiva sobre as proteínas em questão. A purificação de uma proteína deve estar relacionada às propriedades instintivas de uma proteína, incluindo sua estrutura 3D, e até agora cerca de 540 propriedades de aminoácidos foram encontradas. Assim, é possível testar cada propriedade de aminoácido em relação à taxa bem-sucedida de purificação de proteína para descobrir qual propriedade é mais adequada para estimar a propensão à purificação. Neste estudo, cada uma das 535 propriedades foi testada em relação a 438 proteínas purificadas e 429 impossíveis de purificação de Bacillus halodurans usando regressão logística e modelo de rede neural. A análise ROC foi aplicada à sensibilidade e especificidade resultantes. Os resultados mostram que as propriedades da composição de aminoácidos foram geralmente menos úteis para estimar a propensão à purificação, enquanto as propriedades físico-químicas dos aminoácidos, estruturas secundárias e propriedades dinâmicas foram mais úteis, e as propriedades dinâmicas foram mais promissoras. Portanto, vários tipos de propriedades proteicas podem servir para determinar a propensão de purificação de proteínas e têm o potencial de reduzir o custo e acelerar a produção em campos microbiológicos e biotécnicos.